Основні завдання Української протичумної станції:

• надання консультативно-методичної і практичної допомоги закладам охорони здоров'я України з санітарної охорони території від завозу та розповсюдження карантинних та особливо небезпечних інфекційних захворювань на території України;
• виконання функції Центра індикації та ідентифікації біологічних патогенних агентів бактеріальної этиологии (патогенних вібріонів, у т.ч. холерних, а також легионелл, лептоспир);
• виконання функції референс-лабораторії з діагностиці та ідентифікації холерних і інших патогенних вібріонів;
• виконання функції Національної колекції штамів збудників холери О1 і не О1;
• виконання функції базової лабораторій з діагностиці пташиного грипу;
• аналіз і узагальнення матеріалів епідеміологічного нагляду за особливо небезпечними й природно-осередковими інфекціями;
• участь у розробці законодавчих, відомчих нормативних актів, інструктивно-методичних вказівок по санітарній охороні території, профілактиці особливо небезпечних інфекцій;
• створення бригад швидкого реагування й надання практичної допомоги державним органам охорони здоров'я в ліквідації вогнищ карантинних і природно-осередкових особливо небезпечних інфекцій;
• проведення лабораторної діагностики захворювань, викликаних бактеріями I-II груп патогенності, ідентифікація збудників, переносників та ін.